Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Reep6Q9JM62 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Reep6Q9JM62 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms