Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cabp1Q9JLK7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cabp1Q9JLK7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cabp1Q9JLK7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cabp1Q9JLK7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cabp1Q9JLK7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cabp1Q9JLK7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cabp1Q9JLK7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cabp1Q9JLK7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cabp1Q9JLK7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cabp1Q9JLK7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cabp1Q9JLK7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cabp1Q9JLK7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cabp1Q9JLK7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cabp1Q9JLK7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cabp1Q9JLK7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cabp1Q9JLK7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cabp1Q9JLK7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cabp1Q9JLK7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cabp1Q9JLK7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cabp1Q9JLK7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cabp1Q9JLK7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Cabp1Q9JLK7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cabp1Q9JLK7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cabp1Q9JLK7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cabp1Q9JLK7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cabp1Q9JLK7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cabp1Q9JLK7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cabp1Q9JLK7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cabp1Q9JLK7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cabp1Q9JLK7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cabp1Q9JLK7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cabp1Q9JLK7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cabp1Q9JLK7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cabp1Q9JLK7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms