Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkd2l2Q9JLG4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms