Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
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