Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc5a3Q9JKZ2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms