Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrac1Q9JKP8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms