Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pard6bQ9JK83 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pard6bQ9JK83 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms