Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ddx20Q9JJY4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ddx20Q9JJY4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ddx20Q9JJY4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ddx20Q9JJY4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ddx20Q9JJY4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ddx20Q9JJY4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ddx20Q9JJY4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ddx20Q9JJY4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ddx20Q9JJY4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ddx20Q9JJY4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddx20Q9JJY4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddx20Q9JJY4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddx20Q9JJY4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddx20Q9JJY4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddx20Q9JJY4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddx20Q9JJY4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddx20Q9JJY4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddx20Q9JJY4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddx20Q9JJY4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddx20Q9JJY4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddx20Q9JJY4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ddx20Q9JJY4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ddx20Q9JJY4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ddx20Q9JJY4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ddx20Q9JJY4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ddx20Q9JJY4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ddx20Q9JJY4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms