Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Bco1Q9JJS6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bco1Q9JJS6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bco1Q9JJS6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bco1Q9JJS6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bco1Q9JJS6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Bco1Q9JJS6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bco1Q9JJS6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bco1Q9JJS6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bco1Q9JJS6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Bco1Q9JJS6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Bco1Q9JJS6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bco1Q9JJS6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bco1Q9JJS6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bco1Q9JJS6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bco1Q9JJS6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bco1Q9JJS6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Bco1Q9JJS6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Bco1Q9JJS6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Bco1Q9JJS6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Bco1Q9JJS6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bco1Q9JJS6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bco1Q9JJS6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bco1Q9JJS6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bco1Q9JJS6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bco1Q9JJS6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bco1Q9JJS6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bco1Q9JJS6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Bco1Q9JJS6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bco1Q9JJS6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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