Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ascl3Q9JJR7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms