Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Riox1Q9JJF3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riox1Q9JJF3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms