Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms