Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ28

Flii, Protein flightless-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FliiQ9JJ28 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FliiQ9JJ28 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FliiQ9JJ28 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FliiQ9JJ28 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
FliiQ9JJ28 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FliiQ9JJ28 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FliiQ9JJ28 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FliiQ9JJ28 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FliiQ9JJ28 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FliiQ9JJ28 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FliiQ9JJ28 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FliiQ9JJ28 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FliiQ9JJ28 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms