Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad9Q9JIW5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smad9Q9JIW5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms