Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM5

Yipf7, Protein YIPF7, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf7Q9JIM5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Yipf7Q9JIM5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Yipf7Q9JIM5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Yipf7Q9JIM5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Yipf7Q9JIM5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Yipf7Q9JIM5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Yipf7Q9JIM5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Yipf7Q9JIM5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Yipf7Q9JIM5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Yipf7Q9JIM5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Yipf7Q9JIM5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Yipf7Q9JIM5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Yipf7Q9JIM5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Yipf7Q9JIM5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Yipf7Q9JIM5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Yipf7Q9JIM5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Yipf7Q9JIM5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Yipf7Q9JIM5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Yipf7Q9JIM5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Yipf7Q9JIM5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Yipf7Q9JIM5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Yipf7Q9JIM5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Yipf7Q9JIM5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Yipf7Q9JIM5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Yipf7Q9JIM5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Yipf7Q9JIM5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Yipf7Q9JIM5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Yipf7Q9JIM5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Yipf7Q9JIM5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Yipf7Q9JIM5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Yipf7Q9JIM5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Yipf7Q9JIM5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Yipf7Q9JIM5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms