Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG8

Praf2, PRA1 family protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Praf2Q9JIG8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms