Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA1

Lgi1, Leucine-rich glioma-inactivated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi1Q9JIA1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lgi1Q9JIA1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lgi1Q9JIA1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms