Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2ird1Q9JI57 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2ird1Q9JI57 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2ird1Q9JI57 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2ird1Q9JI57 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtf2ird1Q9JI57 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtf2ird1Q9JI57 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtf2ird1Q9JI57 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtf2ird1Q9JI57 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtf2ird1Q9JI57 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtf2ird1Q9JI57 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtf2ird1Q9JI57 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2ird1Q9JI57 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gtf2ird1Q9JI57 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2ird1Q9JI57 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2ird1Q9JI57 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2ird1Q9JI57 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2ird1Q9JI57 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2ird1Q9JI57 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms