Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI13

Utp3, Something about silencing protein 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp3Q9JI13 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp3Q9JI13 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms