Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Brd4Q9ESU6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Brd4Q9ESU6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Brd4Q9ESU6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms