Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim2Q9ESN6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim2Q9ESN6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim2Q9ESN6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim2Q9ESN6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim2Q9ESN6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim2Q9ESN6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim2Q9ESN6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim2Q9ESN6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim2Q9ESN6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim2Q9ESN6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim2Q9ESN6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim2Q9ESN6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim2Q9ESN6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim2Q9ESN6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim2Q9ESN6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim2Q9ESN6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim2Q9ESN6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms