Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Rb1cc1Q9ESK9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rb1cc1Q9ESK9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms