Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OtofQ9ESF1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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