Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DysfQ9ESD7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DysfQ9ESD7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms