Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm7Q9ESD6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms