Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ube3bQ9ES34 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3bQ9ES34 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms