Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc28a3Q9ERH8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc28a3Q9ERH8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc28a3Q9ERH8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc28a3Q9ERH8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc28a3Q9ERH8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc28a3Q9ERH8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc28a3Q9ERH8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms