Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MesdQ9ERE7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MesdQ9ERE7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MesdQ9ERE7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MesdQ9ERE7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MesdQ9ERE7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MesdQ9ERE7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MesdQ9ERE7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MesdQ9ERE7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MesdQ9ERE7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MesdQ9ERE7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MesdQ9ERE7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MesdQ9ERE7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MesdQ9ERE7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MesdQ9ERE7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MesdQ9ERE7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MesdQ9ERE7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MesdQ9ERE7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms