Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scn4aQ9ER60 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn4aQ9ER60 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms