Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kcnn1Q9EQR3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnn1Q9EQR3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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