Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcr6Q9EQ16 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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