Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ap3s1Q9DCR2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap3s1Q9DCR2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms