Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pop7Q9DCH2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pop7Q9DCH2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pop7Q9DCH2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop7Q9DCH2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms