Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Swt1Q9DBQ9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Swt1Q9DBQ9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Swt1Q9DBQ9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms