Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcg8Q9DBM0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcg8Q9DBM0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms