Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrpraQ9DBG7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms