Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Smg9Q9DB90 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Smg9Q9DB90 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Smg9Q9DB90 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Smg9Q9DB90 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Smg9Q9DB90 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Smg9Q9DB90 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Smg9Q9DB90 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Smg9Q9DB90 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Smg9Q9DB90 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Smg9Q9DB90 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Smg9Q9DB90 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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Smg9Q9DB90 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
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Smg9Q9DB90 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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