Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pop5Q9DB28 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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