Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim23Q9DAL0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim23Q9DAL0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim23Q9DAL0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim23Q9DAL0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim23Q9DAL0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim23Q9DAL0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim23Q9DAL0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim23Q9DAL0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim23Q9DAL0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim23Q9DAL0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim23Q9DAL0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim23Q9DAL0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim23Q9DAL0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim23Q9DAL0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim23Q9DAL0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim23Q9DAL0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim23Q9DAL0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim23Q9DAL0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim23Q9DAL0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim23Q9DAL0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim23Q9DAL0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim23Q9DAL0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smim23Q9DAL0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms