Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9DA42 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9DA42 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9DA42 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9DA42 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9DA42 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9DA42 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9DA42 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9DA42 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9DA42 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9DA42 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9DA42 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9DA42 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9DA42 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9DA42 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9DA42 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9DA42 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9DA42 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9DA42 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9DA42 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9DA42 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9DA42 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9DA42 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9DA42 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9DA42 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9DA42 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9DA42 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9DA42 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9DA42 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9DA42 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9DA42 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9DA42 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9DA42 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9DA42 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9DA42 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9DA42 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9DA42 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9DA42 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9DA42 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9DA42 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9DA42 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9DA42 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9DA42 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9DA42 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9DA42 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9DA42 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9DA42 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9DA42 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9DA42 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9DA42 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9DA42 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9DA42 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9DA42 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9DA42 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9DA42 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9DA42 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9DA42 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9DA42 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9DA42 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9DA42 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9DA42 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9DA42 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9DA42 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9DA42 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9DA42 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9DA42 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9DA42 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9DA42 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9DA42 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9DA42 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9DA42 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9DA42 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9DA42 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9DA42 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9DA42 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9DA42 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9DA42 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9DA42 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9DA42 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9DA42 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9DA42 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9DA42 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9DA42 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9DA42 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9DA42 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9DA42 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9DA42 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9DA42 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9DA42 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9DA42 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9DA42 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9DA42 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9DA42 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9DA42 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9DA42 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9DA42 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9DA42 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9DA42 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9DA42 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9DA42 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms