Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smco2Q9DA21 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smco2Q9DA21 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms