Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H2

Cldnd2, Claudin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd2Q9D9H2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldnd2Q9D9H2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms