Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Speer4bQ9D9F7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4bQ9D9F7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms