Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnot8Q9D8X5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms