Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx5Q9D8U8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx5Q9D8U8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms