Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms