Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alkbh4Q9D8F1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms