Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Cldn23Q9D7D7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn23Q9D7D7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn23Q9D7D7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn23Q9D7D7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn23Q9D7D7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn23Q9D7D7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Cldn23Q9D7D7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn23Q9D7D7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Cldn23Q9D7D7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn23Q9D7D7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn23Q9D7D7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn23Q9D7D7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn23Q9D7D7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn23Q9D7D7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn23Q9D7D7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn23Q9D7D7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn23Q9D7D7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn23Q9D7D7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn23Q9D7D7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn23Q9D7D7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn23Q9D7D7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn23Q9D7D7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn23Q9D7D7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn23Q9D7D7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn23Q9D7D7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn23Q9D7D7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn23Q9D7D7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn23Q9D7D7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn23Q9D7D7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn23Q9D7D7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn23Q9D7D7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn23Q9D7D7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn23Q9D7D7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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