Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbe1Q9D6Y9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbe1Q9D6Y9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms