Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
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Ttc9bQ9D6E4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Ttc9bQ9D6E4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Ttc9bQ9D6E4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Ttc9bQ9D6E4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
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Ttc9bQ9D6E4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Ttc9bQ9D6E4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Ttc9bQ9D6E4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Ttc9bQ9D6E4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Ttc9bQ9D6E4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
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Ttc9bQ9D6E4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Ttc9bQ9D6E4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc9bQ9D6E4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Ttc9bQ9D6E4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Ttc9bQ9D6E4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc9bQ9D6E4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Ttc9bQ9D6E4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Ttc9bQ9D6E4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc9bQ9D6E4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Ttc9bQ9D6E4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Ttc9bQ9D6E4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc9bQ9D6E4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc9bQ9D6E4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc9bQ9D6E4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc9bQ9D6E4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc9bQ9D6E4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc9bQ9D6E4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc9bQ9D6E4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc9bQ9D6E4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc9bQ9D6E4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc9bQ9D6E4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc9bQ9D6E4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc9bQ9D6E4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc9bQ9D6E4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc9bQ9D6E4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc9bQ9D6E4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc9bQ9D6E4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc9bQ9D6E4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc9bQ9D6E4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc9bQ9D6E4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms